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 重庆市中医院是集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型三级甲等中医医院，是北京中医药大学非直管附属医院、卫生部国际紧急救援中心网络医院、国家爱婴医院、省级重点中医院建设单位、国家药物临床试验机构。医院现分江北南桥寺院部和渝中区道门口院部，占地163亩，建筑面积6.9万平方米，编制床位966张，设临床科室32个，医技科室10个。有国家临床重点专科1个，国家中医药管理局重点建设学科1个，国家中医药管理局重点专科9个，重点专科培育项目1个，重点研究室1个，二级实验室2个；重庆市级医学和中医药重点学（专）科9个，卫生部诊断鉴定机构2个，重庆市级中西医结合医疗中心3个，重庆市级研究院所2个和重庆市级临床质控中心1个。医院设有中国中医药文献检索中心重庆分中心、全国针灸临床中心重庆分中心，办有《中国中医急症》杂志。重庆市中医药学会、重庆市中西医结合学会、重庆市针灸学会和重庆市中医药行业协会均挂靠在医院。